# New ports collection makefile for:	Bio-Phylo
# Date created:				12 Mar 2006
# Whom:					Aaron Dalton <aaron@FreeBSD.org>
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# $FreeBSD$
#

PORTNAME=	Bio-Phylo
PORTVERSION=	0.16
CATEGORIES=	biology perl5
MASTER_SITES=	CPAN
PKGNAMEPREFIX=	p5-

MAINTAINER=	aaron@FreeBSD.org
COMMENT=	Phylogenetic analysis using perl

BUILD_DEPENDS=	p5-Exception-Class>1.22:${PORTSDIR}/devel/p5-Exception-Class \
		p5-Math-Random>=0.67:${PORTSDIR}/math/p5-Math-Random \
		p5-IO-String>=1.05:${PORTSDIR}/devel/p5-IO-String \
		p5-bioperl>=0:${PORTSDIR}/biology/p5-bioperl \
		p5-SVG>=1.07:${PORTSDIR}/textproc/p5-SVG
RUN_DEPENDS=	${BUILD_DEPENDS}

MAN1=	dndtag.pl.1 \
	droptip.pl.1 \
	bremer.pl.1 \
	age2bl.pl.1 \
	dnd2svg.pl.1
MAN3=	Bio::Phylo.3 \
	Bio::ObjectCompat.3 \
	Bio::Phylo::Adaptor.3 \
	Bio::Phylo::ConfigData.3 \
	Bio::Phylo::Forest.3 \
	Bio::Phylo::Forest::Node.3 \
	Bio::Phylo::Forest::Tree.3 \
	Bio::Phylo::Generator.3 \
	Bio::Phylo::IO.3 \
	Bio::Phylo::Listable.3 \
	Bio::Phylo::Adaptor::Bioperl::Datum.3 \
	Bio::Phylo::Adaptor::Bioperl::Matrix.3 \
	Bio::Phylo::Adaptor::Bioperl::Node.3 \
	Bio::Phylo::Adaptor::Bioperl::Tree.3 \
	Bio::Phylo::Manual.3 \
	Bio::Phylo::Matrices.3 \
	Bio::Phylo::Matrices::Datum.3 \
	Bio::Phylo::Matrices::Datatype.3 \
	Bio::Phylo::Matrices::Matrix.3 \
	Bio::Phylo::Matrices::TypeSafeData.3 \
	Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Custom.3 \
	Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Dna.3 \
	Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Rna.3 \
	Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Restriction.3 \
	Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Protein.3 \
	Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Continuous.3 \
	Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Standard.3 \
	Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Mixed.3 \
	Bio::Phylo::Mediators::TaxaMediator.3 \
	Bio::Phylo::Parsers::Newick.3 \
	Bio::Phylo::Parsers::Nexus.3 \
	Bio::Phylo::Parsers::Table.3 \
	Bio::Phylo::Parsers::Taxlist.3 \
	Bio::Phylo::Taxa.3 \
	Bio::Phylo::Taxa::TaxaLinker.3 \
	Bio::Phylo::Taxa::Taxon.3 \
	Bio::Phylo::Taxa::TaxonLinker.3 \
	Bio::Phylo::Treedrawer.3 \
	Bio::Phylo::Treedrawer::Svg.3 \
	Bio::Phylo::Unparsers::Mrp.3 \
	Bio::Phylo::Unparsers::Newick.3 \
	Bio::Phylo::Unparsers::Nexus.3 \
	Bio::Phylo::Unparsers::Pagel.3 \
	Bio::Phylo::Util::CONSTANT.3 \
	Bio::Phylo::Util::Exceptions.3 \
	Bio::Phylo::Util::IDPool.3 \
	Bio::Phylo::Util::XMLWritable.3

PERL_MODBUILD=	5.7.2+

.include <bsd.port.mk>