diff options
| -rw-r--r-- | biology/p5-Bio-Phylo/Makefile | 147 | ||||
| -rw-r--r-- | biology/p5-Bio-Phylo/distinfo | 4 |
2 files changed, 76 insertions, 75 deletions
diff --git a/biology/p5-Bio-Phylo/Makefile b/biology/p5-Bio-Phylo/Makefile index d48822fc4412..d6c0ff48baf8 100644 --- a/biology/p5-Bio-Phylo/Makefile +++ b/biology/p5-Bio-Phylo/Makefile @@ -6,7 +6,7 @@ # PORTNAME= Bio-Phylo -PORTVERSION= 0.28 +PORTVERSION= 0.30 CATEGORIES= biology perl5 MASTER_SITES= CPAN PKGNAMEPREFIX= p5- @@ -14,81 +14,82 @@ PKGNAMEPREFIX= p5- MAINTAINER= perl@FreeBSD.org COMMENT= Phylogenetic analysis using perl -BUILD_DEPENDS= p5-Exception-Class>1.22:${PORTSDIR}/devel/p5-Exception-Class \ +RUN_DEPENDS= p5-Math-CDF>=0:${PORTSDIR}/math/p5-Math-CDF \ p5-Math-Random>=0.67:${PORTSDIR}/math/p5-Math-Random \ - p5-IO-String>=1.05:${PORTSDIR}/devel/p5-IO-String \ + p5-SVG>=1.07:${PORTSDIR}/textproc/p5-SVG \ + p5-SWF-Builder>=0:${PORTSDIR}/graphics/p5-SWF-Builder \ + p5-XML-Twig>=0:${PORTSDIR}/textproc/p5-XML-Twig \ p5-bioperl>=0:${PORTSDIR}/biology/p5-bioperl \ - p5-SVG>=1.07:${PORTSDIR}/textproc/p5-SVG -RUN_DEPENDS= ${BUILD_DEPENDS} - -MAN3= Bio::Phylo.3 \ - Bio::Phylo::EvolutionaryModels.3 \ - Bio::Phylo::Factory.3 \ - Bio::Phylo::Forest::DrawNode.3 \ - Bio::Phylo::Forest::DrawTree.3 \ - Bio::Phylo::Forest.3 \ - Bio::Phylo::Forest::Node.3 \ - Bio::Phylo::Forest::Tree.3 \ - Bio::Phylo::Generator.3 \ - Bio::Phylo::IO.3 \ - Bio::Phylo::Listable.3 \ - Bio::Phylo::Manual.3 \ - Bio::Phylo::Matrices.3 \ - Bio::Phylo::Matrices::Datum.3 \ - Bio::Phylo::Matrices::Datatype.3 \ - Bio::Phylo::Matrices::Matrix.3 \ - Bio::Phylo::Matrices::TypeSafeData.3 \ - Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Custom.3 \ - Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Dna.3 \ - Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Rna.3 \ - Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Restriction.3 \ - Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Protein.3 \ - Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Continuous.3 \ - Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Standard.3 \ - Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Mixed.3 \ - Bio::Phylo::Mediators::TaxaMediator.3 \ - Bio::Phylo::NeXML::DOM::Element::Twig.3 \ - Bio::Phylo::NeXML::DOM::Document::Twig.3 \ - Bio::Phylo::NeXML::DOM::Document::Libxml.3 \ - Bio::Phylo::NeXML::DOM.3 \ - Bio::Phylo::NeXML::Meta.3 \ - Bio::Phylo::NeXML::Writable.3 \ - Bio::Phylo::NeXML::DOM::Document.3 \ - Bio::Phylo::NeXML::DOM::Element::Libxml.3 \ - Bio::Phylo::NeXML::DOM::Element.3 \ - Bio::Phylo::NeXML::Meta::XMLLiteral.3 \ - Bio::Phylo::Parsers::Newick.3 \ - Bio::Phylo::Parsers::Nexml.3 \ - Bio::Phylo::Parsers::Nexus.3 \ - Bio::Phylo::Parsers::Table.3 \ - Bio::Phylo::Parsers::Taxlist.3 \ - Bio::Phylo::Parsers::Tolweb.3 \ - Bio::Phylo::Project.3 \ - Bio::Phylo::Set.3 \ - Bio::Phylo::Taxa.3 \ - Bio::Phylo::Taxa::TaxaLinker.3 \ - Bio::Phylo::Taxa::Taxon.3 \ - Bio::Phylo::Taxa::TaxonLinker.3 \ - Bio::Phylo::Treedrawer.3 \ - Bio::Phylo::Treedrawer::Abstract.3 \ - Bio::Phylo::Treedrawer::Canvas.3 \ - Bio::Phylo::Treedrawer::Gif.3 \ - Bio::Phylo::Treedrawer::Jpeg.3 \ - Bio::Phylo::Treedrawer::Pdf.3 \ - Bio::Phylo::Treedrawer::Png.3 \ - Bio::Phylo::Treedrawer::Swf.3 \ - Bio::Phylo::Treedrawer::Svg.3 \ - Bio::Phylo::Unparsers::Mrp.3 \ - Bio::Phylo::Unparsers::Newick.3 \ - Bio::Phylo::Unparsers::Nexml.3 \ - Bio::Phylo::Unparsers::Nexus.3 \ - Bio::Phylo::Unparsers::Pagel.3 \ - Bio::Phylo::Util::CONSTANT.3 \ - Bio::Phylo::Util::Logger.3 \ - Bio::Phylo::Util::IDPool.3 \ - Bio::Phylo::Util::Exceptions.3 \ - Bio::Phylo::Util::StackTrace.3 + p5-libxml>=0:${PORTSDIR}/textproc/p5-libxml PERL_CONFIGURE= yes +MAN3= Bio::Phylo.3 \ + Bio::Phylo::EvolutionaryModels.3 \ + Bio::Phylo::Factory.3 \ + Bio::Phylo::Forest::DrawNode.3 \ + Bio::Phylo::Forest::DrawTree.3 \ + Bio::Phylo::Forest.3 \ + Bio::Phylo::Forest::Node.3 \ + Bio::Phylo::Forest::Tree.3 \ + Bio::Phylo::Generator.3 \ + Bio::Phylo::IO.3 \ + Bio::Phylo::Listable.3 \ + Bio::Phylo::Manual.3 \ + Bio::Phylo::Matrices.3 \ + Bio::Phylo::Matrices::Datum.3 \ + Bio::Phylo::Matrices::Datatype.3 \ + Bio::Phylo::Matrices::Matrix.3 \ + Bio::Phylo::Matrices::TypeSafeData.3 \ + Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Custom.3 \ + Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Dna.3 \ + Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Rna.3 \ + Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Restriction.3 \ + Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Protein.3 \ + Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Continuous.3 \ + Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Standard.3 \ + Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Mixed.3 \ + Bio::Phylo::Mediators::TaxaMediator.3 \ + Bio::Phylo::NeXML::DOM::Element::Twig.3 \ + Bio::Phylo::NeXML::DOM::Document::Twig.3 \ + Bio::Phylo::NeXML::DOM::Document::Libxml.3 \ + Bio::Phylo::NeXML::DOM.3 \ + Bio::Phylo::NeXML::Meta.3 \ + Bio::Phylo::NeXML::Writable.3 \ + Bio::Phylo::NeXML::DOM::Document.3 \ + Bio::Phylo::NeXML::DOM::Element::Libxml.3 \ + Bio::Phylo::NeXML::DOM::Element.3 \ + Bio::Phylo::NeXML::Meta::XMLLiteral.3 \ + Bio::Phylo::Parsers::Newick.3 \ + Bio::Phylo::Parsers::Nexml.3 \ + Bio::Phylo::Parsers::Nexus.3 \ + Bio::Phylo::Parsers::Table.3 \ + Bio::Phylo::Parsers::Taxlist.3 \ + Bio::Phylo::Parsers::Tolweb.3 \ + Bio::Phylo::Project.3 \ + Bio::Phylo::Set.3 \ + Bio::Phylo::Taxa.3 \ + Bio::Phylo::Taxa::TaxaLinker.3 \ + Bio::Phylo::Taxa::Taxon.3 \ + Bio::Phylo::Taxa::TaxonLinker.3 \ + Bio::Phylo::Treedrawer.3 \ + Bio::Phylo::Treedrawer::Abstract.3 \ + Bio::Phylo::Treedrawer::Canvas.3 \ + Bio::Phylo::Treedrawer::Gif.3 \ + Bio::Phylo::Treedrawer::Jpeg.3 \ + Bio::Phylo::Treedrawer::Pdf.3 \ + Bio::Phylo::Treedrawer::Png.3 \ + Bio::Phylo::Treedrawer::Swf.3 \ + Bio::Phylo::Treedrawer::Svg.3 \ + Bio::Phylo::Unparsers::Mrp.3 \ + Bio::Phylo::Unparsers::Newick.3 \ + Bio::Phylo::Unparsers::Nexml.3 \ + Bio::Phylo::Unparsers::Nexus.3 \ + Bio::Phylo::Unparsers::Pagel.3 \ + Bio::Phylo::Util::CONSTANT.3 \ + Bio::Phylo::Util::Logger.3 \ + Bio::Phylo::Util::IDPool.3 \ + Bio::Phylo::Util::Exceptions.3 \ + Bio::Phylo::Util::StackTrace.3 + .include <bsd.port.mk> diff --git a/biology/p5-Bio-Phylo/distinfo b/biology/p5-Bio-Phylo/distinfo index bb03a2b64ad2..a6999a0d0cdf 100644 --- a/biology/p5-Bio-Phylo/distinfo +++ b/biology/p5-Bio-Phylo/distinfo @@ -1,2 +1,2 @@ -SHA256 (Bio-Phylo-0.28.tar.gz) = f72e5a9e43502ea9020faa17c9c20e0a4cd5f34db967888547fbce0dc742b835 -SIZE (Bio-Phylo-0.28.tar.gz) = 241143 +SHA256 (Bio-Phylo-0.30.tar.gz) = 9600ecdedc5147fb1e15265c6a7e3b3648ec9d953c234864e779ed83edfcf087 +SIZE (Bio-Phylo-0.30.tar.gz) = 241313 |