blob: d48822fc44124184ebbeb70fcf11aaf793063999 (
plain) (
blame)
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
|
# New ports collection makefile for: Bio-Phylo
# Date created: 12 Mar 2006
# Whom: Aaron Dalton <aaron@FreeBSD.org>
#
# $FreeBSD$
#
PORTNAME= Bio-Phylo
PORTVERSION= 0.28
CATEGORIES= biology perl5
MASTER_SITES= CPAN
PKGNAMEPREFIX= p5-
MAINTAINER= perl@FreeBSD.org
COMMENT= Phylogenetic analysis using perl
BUILD_DEPENDS= p5-Exception-Class>1.22:${PORTSDIR}/devel/p5-Exception-Class \
p5-Math-Random>=0.67:${PORTSDIR}/math/p5-Math-Random \
p5-IO-String>=1.05:${PORTSDIR}/devel/p5-IO-String \
p5-bioperl>=0:${PORTSDIR}/biology/p5-bioperl \
p5-SVG>=1.07:${PORTSDIR}/textproc/p5-SVG
RUN_DEPENDS= ${BUILD_DEPENDS}
MAN3= Bio::Phylo.3 \
Bio::Phylo::EvolutionaryModels.3 \
Bio::Phylo::Factory.3 \
Bio::Phylo::Forest::DrawNode.3 \
Bio::Phylo::Forest::DrawTree.3 \
Bio::Phylo::Forest.3 \
Bio::Phylo::Forest::Node.3 \
Bio::Phylo::Forest::Tree.3 \
Bio::Phylo::Generator.3 \
Bio::Phylo::IO.3 \
Bio::Phylo::Listable.3 \
Bio::Phylo::Manual.3 \
Bio::Phylo::Matrices.3 \
Bio::Phylo::Matrices::Datum.3 \
Bio::Phylo::Matrices::Datatype.3 \
Bio::Phylo::Matrices::Matrix.3 \
Bio::Phylo::Matrices::TypeSafeData.3 \
Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Custom.3 \
Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Dna.3 \
Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Rna.3 \
Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Restriction.3 \
Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Protein.3 \
Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Continuous.3 \
Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Standard.3 \
Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Mixed.3 \
Bio::Phylo::Mediators::TaxaMediator.3 \
Bio::Phylo::NeXML::DOM::Element::Twig.3 \
Bio::Phylo::NeXML::DOM::Document::Twig.3 \
Bio::Phylo::NeXML::DOM::Document::Libxml.3 \
Bio::Phylo::NeXML::DOM.3 \
Bio::Phylo::NeXML::Meta.3 \
Bio::Phylo::NeXML::Writable.3 \
Bio::Phylo::NeXML::DOM::Document.3 \
Bio::Phylo::NeXML::DOM::Element::Libxml.3 \
Bio::Phylo::NeXML::DOM::Element.3 \
Bio::Phylo::NeXML::Meta::XMLLiteral.3 \
Bio::Phylo::Parsers::Newick.3 \
Bio::Phylo::Parsers::Nexml.3 \
Bio::Phylo::Parsers::Nexus.3 \
Bio::Phylo::Parsers::Table.3 \
Bio::Phylo::Parsers::Taxlist.3 \
Bio::Phylo::Parsers::Tolweb.3 \
Bio::Phylo::Project.3 \
Bio::Phylo::Set.3 \
Bio::Phylo::Taxa.3 \
Bio::Phylo::Taxa::TaxaLinker.3 \
Bio::Phylo::Taxa::Taxon.3 \
Bio::Phylo::Taxa::TaxonLinker.3 \
Bio::Phylo::Treedrawer.3 \
Bio::Phylo::Treedrawer::Abstract.3 \
Bio::Phylo::Treedrawer::Canvas.3 \
Bio::Phylo::Treedrawer::Gif.3 \
Bio::Phylo::Treedrawer::Jpeg.3 \
Bio::Phylo::Treedrawer::Pdf.3 \
Bio::Phylo::Treedrawer::Png.3 \
Bio::Phylo::Treedrawer::Swf.3 \
Bio::Phylo::Treedrawer::Svg.3 \
Bio::Phylo::Unparsers::Mrp.3 \
Bio::Phylo::Unparsers::Newick.3 \
Bio::Phylo::Unparsers::Nexml.3 \
Bio::Phylo::Unparsers::Nexus.3 \
Bio::Phylo::Unparsers::Pagel.3 \
Bio::Phylo::Util::CONSTANT.3 \
Bio::Phylo::Util::Logger.3 \
Bio::Phylo::Util::IDPool.3 \
Bio::Phylo::Util::Exceptions.3 \
Bio::Phylo::Util::StackTrace.3
PERL_CONFIGURE= yes
.include <bsd.port.mk>
|